医院系统的洁净室用于手术室，也就是我们现在所说的医院手术室净化工程。开始它只是在矫形手术中获得广泛应用,因为矫形手术时间较长,易于引起感染。控制水平较理想的是使用手术台附近的空气洁净度达到100级。一般建议使用顶部高效空气过滤系统,它能覆盖至少3m×3m的面积,从而将手术台和人包括在内。

    医院应用洁净环境最广泛的洁净手术室，是用空气洁净技术取代传统的紫外线等手段对全过程实行污染控制的现代手术室。在洁净手术室内，患者感染率可降低10倍以上，从而可以少用或不用会伤害患者免疫系统的抗生素。既要无尘又要无菌是洁净手术室的特点。

    医院洁净室包括手术室、产科、婴幼儿病房(NICU)、ICU(重症监护室)、烧伤病房及解剖室、净化实验室、人工透析室、标本室等，其工程质量与医疗质量有着直接而重要的关系。

    手术室净化工程是采用空气层流超净化装置，将空气中的尘埃粒子和细菌高效过滤、消毒，达到除尘灭菌效果，创造一个洁净舒适的手术空间环境。采用国际的钢结构手术室设计，严格按照中华人民共和国建设部、卫生部之<医院洁净手术室建设标准>建造。

    外置12mm保温防撞隔音板材，保证保温，防撞隔音达到国际标准；内侧防锈彩钢板经6次真空离子防菌喷涂；走道及手术室均为无缝地板，以维持手术室之无尘无菌状态。室内恒温、恒湿、恒压，每小时换气600次，空气洁净度达99.98%，是目前最手术装备之一。